公司交了医保没有余额的原因是有可能是个人账户中的金额用完了，还有可能是灵活就业人员身份参保的或者是查询方式不对等因素。详情是：
1、个人账户的金额用完了
公司交了医保，会有部分进入到个人账户当中，有可能是账户里的金额用完了。因此会显示没有余额。
2、灵活就业人员参保
如果是用灵活就业人员参保的话，一般是没有个人账户，就会显示余额。
3、查询方式不对
在进行医保查询的时候，用社保卡到银行的ATM机子上查询，只能查询到社保卡里的金融账户的额度，如果金融账户里没钱的话，就是余额为0，社保个人账户里的金额可以通过定点医疗机构或官网查询。
4、系统延迟
当月缴纳社保后，在扣缴成功以后还需要一定的工作日时间才能到账的，系统会产生延迟，就是公司已经扣了，但是网上却没有余额的情况。
5、社保卡未激活
社保卡没有激活，也是无法正常查询社保卡余额的。
6、公司还没有进行代缴
在通过社保官网查询后，如果没有查到，显示余额为0，也可能是公司还没有进行社保的代扣，可以找公司的社保负责人问问。
7、医保缴纳的档次不同
医保有几个档次，参保档次不同，比如缴纳的深圳社保是第二三档医保，因为只有参加深圳医保一档，才拥有医保个人账户，深圳二三档医保是没有医保个人账户的。还有东莞地区的，金卡才有个人账户，银卡是没有的。
8、新参保人员
新参保人员，个人账户金额还没有划入，余额就显示为0，有的城市需要缴纳三个月后，才会划入的。
9、社保卡没有及时更新
社保卡仍旧是老版的社保卡，没有更新到最新的社保卡，查询的时候，会显示余额为0的情况。
10、交的城乡居民医保
有可能缴纳的医保还是城乡居民医保，这种情况是不建立个人医保账户的，余额是0的。