济宁济惠保的保障内容包括基本医保内外住院医疗费用和特定药品医疗费用保障，其中：
医保内外住院医疗费用并不是仅对某些疾病进行保障，而是可以对参保人在济宁市基本医保定点医疗机构、经异地就医备案的医疗机构住院医疗所发生的医保范围内外的合规医疗费用（不包括用现金和个人账户支付的门诊、购药），经由基本医保、大病保险、医疗救助、特惠保等报销后仍由个人负担的医疗费用进行报销；
特定药品医疗费用保障是可以对《济惠保特定药品目录》中药品所支出的特定药品医疗费用进行报销，而这些药品所对应可使用的罕见病包括脊髓型肌萎缩症、黏多糖贮积症Ⅰ型、黏多糖贮积症Ⅱ型、黏多糖贮积症ⅣA型、纯合子型家族性高胆固醇血症、成年野生型或遗传转甲状腺素蛋白质粉样变性心肌病、遗传性血管性水肿、X连锁低磷血症。