1.参保人群不同
灵活就业养老保险属于城镇职工基本养老保险的范畴，所以其参保人群是在职职工、个体工商户和灵活就业人员；居民养老保险主要面对具有当地户口却没有工作的居民，不管是城镇户口还是农村户口，均可参加。
2.缴费标准不同
灵活就业养老保险一般按当地上年社会平均工资水平的60%~300%设置不同的缴费档次，通过银行代扣代缴按月交费，每年缴费在几千~几万块钱不等；居民养老保险在统一的时间段内按年缴纳，缴费标准分为几百元到几千元多个档次，个人可自愿选择缴纳档次。
3.缴费补贴不同
城乡居民养老保险直接补到个人账户，缴费档次越高，补贴程度越高；灵活就业养老保险也有补贴，直接补贴给个人，主要是针对就业困难人员的。
4.退休年龄不同
参加城乡居民养老保险，男、女退休年龄均为60周岁；而男性灵活就业人员的退休年龄为60周岁，女性为55周岁，少数地区女性可以在50周岁时办理退休。
5.待遇水平不同
从待遇领取上来看，目前职灵活就业养老保险的水平要远远高于居民养老保险。