亏损企业在进行企业所得税汇算清缴时，需要遵循以下步骤：
1. 确定亏损金额：根据财务报表，确定企业当年的亏损金额。
2. 弥补亏损：根据《中华人民共和国企业所得税法》的规定，企业纳税年度发生的亏损，准予向以后年度结转，用以后年度的所得弥补，但结转年限最长不得超过5年。
3. 计算应纳税所得额：在确定亏损金额的基础上，通过一系列的调整，计算出应纳税所得额。
4. 计算应纳所得税额：根据应纳税所得额，计算出应纳所得税额。
5. 计算实际应纳所得税额：在应纳所得税额的基础上，考虑各种税收优惠政策和税收抵免情况，计算出实际应纳所得税额。
6. 缴纳税款：根据实际应纳所得税额，及时足额缴纳税款。
需要注意的是，以上步骤只是大致的操作流程，具体的操作还需要根据企业的具体情况和税务部门的具体要求来进行。如果有任何疑问，建议咨询专业的税务人员或者直接联系税务部门进行咨询。