上海补充公积金的缴费率为1%~5%，具体缴费率可选择1%、2%、3%、4%、5%。补充公积金的缴存比例由单位确定。缴存比例一经确定，就不能随意改变。单位和个人的缴费比例相同。
上海补充公积金缴费率确定后，补充公积金缴费率的计算方法与公积金相同，即月缴费率=缴费率基数×缴费率×2。缴费基数以员工上一年度的月平均工资为基础。
值得一提的是，补充公积金的缴费基数也有上限和下限。上海市补充公积金缴存基数上限为34188元，缴存基数下限为2590元。以此缴费基数计算，缴费时补充公积金最高缴存金额为34188 ×5%×2=3418元，最低缴存金额为2590×1%×2=52元。
补充公积金与住房公积金最大的区别在于，补充公积金的缴费率低于住房公积金，住房公积金的缴费率范围为5%-7%。
补充公积金和公积金的区别是什么？
强制性不同：根据国家规定企业需要为在职员工缴存住房公积金，这是最基本的保障，若是不按规定缴纳，将会受到相应的处罚。而补充公积金不是国家强制的，属于企业给予在职员工的一种补贴。
范围不同：但凡是在国家规定范围内的机构工作的职工，需要根据规定缴纳住房公积金，而部分效益较好的企业才具备缴纳补充住房公积金的资格。
限制不同：住房公积金按照不同地区规定的比例缴纳，与工资基数有关，有一定的限额，而补充公积金则没有。
