代垫运费的增值税在某些情况下是可以抵扣的。
如果代垫运费符合相关税收政策的条件，那么这部分运费对应的进项税额是可以用来抵扣增值税的。具体来说，如果销售方代垫的运费不属于价外费用，即实际付款者是购货方，那么这部分运费可以不计入销售额计税。对于购买方而言，如果其是增值税一般纳税人，并且承运公司开具了增值税专用发票，那么运费对应的进项税额可以抵扣增值税。
在实际操作中，企业应当根据增值税相关政策法规和自身情况，合理处理代垫运费的税务问题。同时，企业应确保所有税务操作都符合法律法规的要求，避免因违规操作而受到税务处罚。
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